MySQLのバイナリログは5.0以前と5.1以降で保存場所が異なります。
5.0以下ならdatadirで指定したディレクトリと同じです。
5.1以上ならPIDファイルと同じディレクトリになります。
今回は自分で設定したい場合の記述方法です。
vi /etc/my.cnf
log-bin = /var/lib/mysql/mysql-bin
例の場合、/var/lib/mysqlの中にmysql-bin.00000xという（xは数字）でバイナリログが保存されていきます。
これでMySQLを再起動してください。
活用方法
使用しているMySQLが5.1で、バックアップする対象をデータ保存領域と同じにしたい（5.0以前と同じ）場合などに便利です。
または大容量の接続しているストレージに指定することも可能です。
レプリケーションをしている場合は、連携を考えて指定場所を記述するといいです。
